Allora... per prima cosa complimenti per il tuo primo 1000° messaggio ...
Se non sbaglio usi bukkit vero? Allora ad esempio dipende tutto da che mod devi usare... ad esempio nodus , too many items , optifine vanno tranquillamente (too many items solo se hai il permission ) , ma ad esempio non potresti usare qualcosa come la Zeppelin mod....
Se usi bukkit dovresti trovare una cartella con scritto mods tra i file del server (mi sembra, è da un po che non faccio un server D: ) li ci metti le mods come se fossero dei plug-in e anche gli altri giocatori devono avere le mod se non è cambiato nulla dalla 1.3.2